黒い太陽～コードネーム：アムネシア～
密航船で謎の男が発見される。伸び放題の髪とひげ、拷問のあとをうかがわせる傷跡。男は1年前、任務遂行中に死亡したと思われた国家情報院の要員、ハン・ジヒョクだった。彼は1年間の記憶をすべて失っていた。最優秀のエージェントとして名をはせた彼の変わり果てた姿に、国家情報院内部に動揺が走る。ジヒョクは記憶を失くしたまま国家情報院に復帰することになる。
黒い太陽～コードネーム：アムネシア～ 第01話／字幕
字幕／第1回／密航船で謎の男が発見される。彼は1年前に失踪し死亡扱いになっていた国家情報院の要員、ハン・ジヒョクだった。ジヒョクは、この1年間の記憶をすべて失っていた。彼の元直属の上司ハ・ドンギュンチーム長、カン・ピロ海外情報局長、海外部門の責任者ト・ジンスク次長は、ジヒョク発見の報を聞き、歓迎するどころか当惑した面持ちだ。
黒い太陽～コードネーム：アムネシア～ 第02話／字幕
字幕／第2回／1年前、中国の瀋陽で任務を遂行中だったジヒョクは、パートナーを惨殺され、彼自身は行方不明となっていた。ジヒョクはカン局長に、この件を調査させてくれと訴えるが、犯罪情報統合センターの現場支援チームに配属される。パートナーは情報分析室出身のユ・ジェイ。ある日、マンションの窓から見えるライトが気になったジヒョクは……。
黒い太陽～コードネーム：アムネシア～ 第03話／字幕
字幕／第3回／国情院内の裏切り者を探すため、ジヒョクは自らの手で記憶を消していた。そんな中、アイドル歌手が麻薬を使用し死亡した事件から、北朝鮮産の麻薬を韓国に流通させているファヤン派の情報が入る。1年前のジヒョクの任務も、このファヤン派がらみだった。組織のナンバー2チャン・グァンチョルが韓国に入国したことを知ったハチーム長は……。
黒い太陽～コードネーム：アムネシア～ 第04話／字幕
字幕／第4回／ト次長の指示でジヒョクが、逮捕されたグァンチョルを取り調べることになる。暴力的な尋問をするジヒョクにグァンチョルは、「お前は死んだも同然だ」と叫ぶ。グァンチョルの運転手をしていた男に、何か思い出したら連絡をくれと自分の連絡先を教えるジヒョク。警察署を後にするが、その頃ファヤン派が大挙して警察署を襲い署は大混乱となる。
黒い太陽～コードネーム：アムネシア～ 第05話／字幕
字幕／第5回／ついに姿を現したファヤン派のボス、ファン・モスル。ジヒョクは監視カメラの映像から、瀋陽での情報提供者チュンギルがファヤン派として韓国にいることを知る。1人で調査を続けるため、ト次長に1週間の休暇を申請するジヒョク。ト次長はジヒョクの意図を知りながら許可する。ジヒョクはジェイに、チュンギルの捜索に協力してくれと頼む。
黒い太陽～コードネーム：アムネシア～ 第06話／字幕
字幕／第6回／ジェイの調査の結果、大量の麻薬がコンテナで密輸されることをつかむジヒョク。港でコンテナを調べていたジヒョクはファヤン派に捕まる。ホテルでモスルに拷問されるジヒョクは、ペク謀士と呼ばれる謎の人物が背後にいることを知る。飲み込んでいたGPSを吐きだして壊すのを合図に、ジェイが慣れない拳銃を手にホテルの部屋に突入する……。
黒い太陽～コードネーム：アムネシア～ 第07話／字幕
字幕／第7回／国情院のサーバーがハッキングされ、機密情報が盗まれる。犯人は、ジェイの元上司で自殺したチェ・イルラク課長の息子サンギュン。ジヒョクはチュンギルから聞いた話を確認しようとするが、情報はサーバーから消されていた。ジヒョクとジェイは、国情院に追われるサンギュンに接触する。「1年前の約束を覚えているか」と聞かれたジヒョクは……。
黒い太陽～コードネーム：アムネシア～ 第08話／字幕
字幕／第8回／国情院で激しく対立するジヒョクたち海外部門と国内部門。サンギュンを捜索する責任者は、ジヒョクのかつての同僚で今は国内部門のソ・スヨンチーム長。密かにサンギュンと接触しようとするジヒョクとジェイに、スヨンはいきり立つ。結局、サンギュンは逮捕されるが、国情院のサーバーにサンギュンが仕込んだウイルスが広がり……。
黒い太陽～コードネーム：アムネシア～ 第09話／字幕
字幕／第9回／ジヒョクはサンギュンから、チュンギルが非常連絡網を使って助けを求めた人物が、スヨンだったと聞かされる。彼女の首を絞めて問い詰めるが、そのまま気を失い倒れるジヒョク。彼はスヨンに謝罪するが、一方で彼女に疑惑を持ち調査を始める。ジェイはスヨンの依頼で、脱北者出身の記者が、北朝鮮に脱北者の情報を流した事件を調査する。
黒い太陽～コードネーム：アムネシア～ 第10話／字幕
字幕／第10回／記者のスパイ事件から、瀋陽で活躍し、今は姿を消した潜入工作員チャン・チョヌの存在が浮かび上がる。チョヌをあぶり出す計画を立てるジヒョクとジェイ。一方、チョヌはジヒョクを監視していた。ジェイの調査で、チョヌとスヨンの関係が明らかになるが、ジェイがチョヌにさらわれてしまう。チョヌはジヒョクに、この件から手を引けと警告する。